与创世论不同，智能设计论并不宣称上帝是智能设计者，它只是认为在自然界中有明显的证据表明智能设计的存在。智能设计论中的设计者可能是上帝，也可能是地外物种或者是某种超自然的力量。此外，智能设计论也不直接从基督教《圣经》中寻找论据。

但是，尽管智能设计论承认在一个物种内可能会有微小的进化上的改变，但它并不认为一个物种能从另一个物种进化而来，也不承认高度复杂的生物系统可能是自然选择的结果。智能设计论的拥护者表示，他们的目的在于揭露作为主流物种起源理论的达尔文学说中的问题，并从科学与文化中剔除自然主义的影响（自然主义认为我们周围的万物都可以由自然的原因解释）。